Главная причина отличия Армянской церкви от Православной – вероучительные расхождения. Армяно-Григорианская Церковь является одной из старейших в христианском мире. Учение Иисуса Христа было принесено в эту землю еще в апостольские времена. В качестве государственной религии Армения приняла христианство в 301 году, причем в форме монофизитства, т.е. учения о том, что у Иисуса Христа есть только одна природа – божественная. А Русская Православная Церковь верует в двойную природу Христа – божественную и человеческую. Эта догма сводится к двум положениям: 1) у Христа две природы (естества), 2) но одно лицо и одна ипостась (Богочеловек).
Орос (вероопределение) о двойственности природы Иисуса Христа был принят на IV Вселенском соборе в Халкидоне в 451 году. До этого существовала Единая Апостольская Церковь. После Вселенского собора пути Армянской и Православной Церквей разошлись, а Армянская Церковь стала называться дохалкидонской, или монофизитской. Отношения Армянской и Православной церквей к Определению IV Вселенского собора прямо противоположны, что и составляет их главное отличие друг от друга.