Йогурт и простокваша являются кисломолочными продуктами, но отличаются по своему составу и способу приготовления. Так, для получения йогурта используют два вида смесей заквасочных микроорганизмов: болгарскую молочнокислую палочку и термофильные молочнокислые стрептококки. А простоквашу можно приготовить без добавок, оставив молоко скисать при комнатной температуре, либо с помощью закваски из лактококков, реже – из термофильных молочнокислых стрептококков.
Жирность простокваши всегда не ниже 3,2%, тогда как доля жира в йогурте допускается меньше, чем 3,2%. В йогурт, для придания более насыщенного вкуса, добавляют фруктовые или ягодные компоненты, простокваша же не содержит никаких добавок. По консистенции йогурт более густой и вязкий, чем простокваша, иногда он может быть желеобразным. Простокваша напоминает внешним видом сметану.