Скважина от колодца отличается как способом разработки, так и устройством. Так, колодец копается на глубину залегания грунтовых вод, тогда как скважина бурится специальными машинами, и глубина скважины может быть гораздо большей, чем колодца и доставать до артезианских вод.
В колодце вода набирается сама по мере вычерпывания, а в скважине вода качается с помощью насоса. Колодец имеет больший диаметр, чем скважина, он обкладывается деревянными бревнами или бетонными кольцами для избегания обвала стен, а скважина представляет собой трубу. Поэтому в колодце есть возможность брать воду механическим (ручным) способом, опуская вниз ведро и зачерпывая воду, в скважине такой возможности нет.
Колодец проще и дешевле чистить, чем скважину. Но ради справедливости стоить заметить, что и загрязняется он быстрее, чем скважина. На колодец можно поставить любой насос, даже «плавающий», тогда как на скважину ставятся только специальные глубинные насосы.
В колодец может нечаянно упасть лягушка, кошка или даже человек, в скважине такое исключено.