Главное отличие в том, что перевозчик имеет свой автопарк, а экспедитор нет. Перевозчики доставляют груз только с помощью автомашин, тогда как возможности экспедитора в этом вопросе намного больше. Экспедиторы могут организовать доставку и ж/д, и воздушным, и морским видами транспорта. Стоимость услуг экспедиторов обычно выше стоимости услуг перевозчиков (экспедиторы делают надбавку за свои услуги).
В базу данных экспедиторов входят, как правило, достаточно большое количество перевозчиков, поэтому они могут предоставить больше видов автомобилей и их количество. Но перевозчики быстрее дают информацию о возможности доставки груза, так как хорошо знают загруженность собственного автопарка. Экспедиторам же необходимо время, чтобы обзвонить всех перевозчиков из своей базы данных.
Экспедиторы могут предоставлять дополнительные услуги, например, оформление документации, перевозчики же занимаются только предоставлением автотранспорта.