Ликвидацией называется физическое прекращение деятельности юрлица. Документально это подтверждается свидетельством об исключении организации из реестра юрлиц, выданной налоговой службой. С этого момента правоспособность юрлица прекращается.
Реорганизация это тоже прекращение деятельности, но только с переходом прав к другой организации (правопреемство). Реорганизация проходит в форме преобразования (смена ОПФ), разделения, выделения, присоединения и слияния. Каждая форма предполагает свой порядок реорганизации и момент прекращения деятельности реорганизуемого юрлица.
В процессе ликвидации удовлетворяются требования кредиторов, т.е. закрываются все долги: выплаты по обязательствам, налоги, зарплата и тп. В случае недостаточности средств для погашения таких требований, имущество выставляется на торги и требования кредиторов погашаются в очередности, установленной законом. При реорганизации таких проблем нет, т.к. все права и обязанности (в том числе и долги) переходят к вновь образованному лицу в порядке универсального правопреемства.