Кайманы от крокодилов отличаются наличием на животе костного панциря. Голова каймана напоминает параболическую кривую и выглядит в форме буквы U, а голова крокодила похожа на голову щуки и напоминает форму буквы V.
При сомкнутой челюсти у крокодила видны как минимум 2 верхних зуба с каждой стороны, а у каймана зубы прикрыты верхней губой. Сама верхняя губа у крокодилов более извилиста, чем у кайманов. Крокодилы имеют специальные железы, позволяющие им свободно чувствовать себя в соленой морской воде, а у кайманов эти железы отсутствуют, поэтому живут они исключительно в пресной воде.
Кожа головы крокодилов более чувствительная, она вся усыпана датчиками-сенсорами, реагирующими на движение. Кожа кайманов менее чувствительна, такие датчики располагаются лишь не коже головы и немного вокруг морды пресмыкающегося.
Крокодилы распространены гораздо шире, чем кайманы и количество видов крокодилов тоже больше, чем у кайманов.